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Analyse multi-omique

Bulk RNA-seq
Single-Cell
Classification ML
Rapport PDF

Myopathie à analyser :

📂 Upload Count Matrix (CSV / TSV)
rows=gènes · cols=samples + condition · top 50 DEG extraits automatiquement
⚙️ Analysis Parameters
Adjusted p threshold0.050
|log2 Fold Change| threshold1.00
Top genes for heatmap30
📂 Upload Single-Cell Data (CSV / H5AD)
rows=cellules · cols=gènes · ou fichier AnnData H5AD (Scanpy/Seurat)
⚙️ scRNA-seq Parameters
n_neighbors (UMAP)15
min_dist (UMAP)0.30
Leiden resolution0.50
Min genes / cell200
Min cells / gene3
Markers per cluster5

MYOomics

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Analyse Multi-Omique des Myopathies et Maladies Musculaires par IA

MYOomics est une plateforme d'analyse multi-omique spécialisée dans les myopathies et maladies musculaires héréditaires. Elle intègre les données transcriptomiques (RNA-seq, scRNA-seq), protéomiques et génomiques pour identifier des biomarqueurs diagnostiques et pronostiques.

La plateforme propose des pipelines d'analyse RNA-seq (bulk et single-cell), une méta-analyse intégrée de données publiques sur les myopathies (DMD, LGMD, SMA, myopathies mitochondriales), ainsi qu'un module de machine learning pour la classification et la prédiction de phénotypes musculaires.

Fonctionnalités principales

Pour qui ?

Destiné aux chercheurs en biologie neuromusculaire, médecins spécialistes des maladies neuromusculaires, bioinformaticiens et équipes de recherche translationnelle sur les myopathies rares.

Questions fréquentes

Quelles myopathies sont couvertes par la méta-analyse intégrée ?

La méta-analyse intègre des données sur la dystrophie musculaire de Duchenne (DMD), les dystrophies des ceintures (LGMD), l'amyotrophie spinale (SMA), les myopathies mitochondriales, la myopathie de Becker et les myopathies inflammatoires (polymyosite, dermatomyosite).

Comment intégrer mes propres données RNA-seq ?

Importez vos données de comptage (matrice gènes × échantillons en format CSV/TSV) accompagnées des métadonnées (condition, groupe, sexe, âge). La plateforme applique automatiquement la normalisation et l'analyse différentielle selon les paramètres que vous définissez.

Les analyses sont-elles publiables ?

Oui. Les méthodes (DESeq2, edgeR, GSEA) sont des outils standards publiables. Vous devez citer les packages utilisés et décrire votre pipeline dans la section Méthodes de votre article.

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